Siamo nel 2271. Un’entità sconosciuta sotto forma di nebulosa ha avviluppato vari vascelli Klingon, distruggendoli. La U.S.S. Enterprise è pronta a investigare e l’Ammiraglio Nogura viene convinto dall’Ammiraglio James T. Kirk a lasciargli il comando dell’astronave, appena rimodernata. Nel frattempo, su Vulcano, Spock sta preparandosi per il rito del Kolinhar – la dedizione alla pura logica vulcaniana – e la purificazione dalle emozioni residue. Ma proprio in quel momento la sua metà umana percepisce l’entità aliena: l’interruzione della meditazione obbliga i Maestri Vulcaniani a rifiutare l’ammissione di Spock nei loro ranghi.
In 2271 an unknown, cloud-like entity descends upon several Klingon vessels and destroys them. The U.S.S. Enterprise is readying to investigate the cloud entity. Admiral Nogura is persuaded by Admiral James T. Kirk to hand over command of the newly refit Starship Enterprise to him. Meanwhile, on Vulcan, Spock is preparing to undergo the rite of Kolinahr — the achievement of total Vulcan logic — and the purging of all remaining emotion. Just then Spock’s human half stirs in response to the cloud entity, interrupting his meditation and forcing the Vulcan masters to withdraw Spock’s admission to their ranks.